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jueves, 25 de octubre de 2012

Investigación en neurociencias

Comprender cómo funciona el cerebro es uno de los grandes retos de la investigación científica del siglo XXI. El sistema nervioso se define como un conjunto de elementos que nos permite recibir estimulación externa a través de impulsos nerviosos y traducirlos en diversas reacciones. Las unidades básicas de nuestro sistema nervioso son las neuronas, que se encuentran conectadas a través de sinapsis.  


Conocer todo sobre estas conexiones es una de las claves para comprender cómo funciona el cerebro. En este aspecto, el Human Connectome Project (HCP) intenta dilucidar las vías de señalización neuronales, claves en la función cerebral. 


Para comprender cómo funciona el cerebro tenemos que saber qué conecta con qué. En este sentido, dos grupos de neurocientíficos han reconstruido los impulsos eléctricos del cerebro y los han relacionado con la función individual de cada célula. Este ámbito de la investigación se conoce como "conectómica". Un grupo de investigadores pertenecientes al Max Planck Institute for Medical Research en Alemania se centró en el estudio de la retina, mientras que los investigadores de la Universidad de Harvard en Boston analizaron el área del cerebro en la que se procesa la información que proviene de la retina. En el siguiente vídeo podemos ver cómo funciona esta nueva técnica y como los científicos han reconstruido las conexiones en el cerebro de un ratón y las han relacionado con la función de cada célula. 



Este mes, Randolf Menzel ha publicado en Nature Reviews Neuroscience cómo las abejas pueden constituir un modelo animal de gran validez para la comprensión de la relación entre comportamiento y conocimiento, ya que muestran un comportamiento social complejo controlado por un cerebro de aproximadamente 1 millón de neuronas. Hasta ahora, las abejas se han empleado como modelo en estudios de aprendizaje y memoria. Podéis acceder al artículo en el siguiente enlace.

Un accidente cerebrovascular, ictus cerebral o aplopejía es la pérdida de la función cerebral por la interrupción del fujo de sangre al cerebro. Es una causa importante de muerte y representa una de las principales causas de discapacidad. En el siguiente vídeo podemos observar cómo se está investigando en un centro de neurociencias en Australia para emplear la consola de videojuegos Wii como terapia para mejorar el movimiento en pacientes que han sufrido una aplopejía, que ha dado lugar a discapacidades.



Si queréis profundizar en las técnicas de imagen que se utilizan principalmente en neurociencias, podéis consultar la revisión de Thomas Misgeld y Martin Kerschensteiner publicada en Nature Review Neuroscience. El resumen que aparece a continuación está extraído del artículo.


Una enfermedad neurológica de una alta prevalencia es la enfermedad de Alzheimer. En el siguiente vídeo, elaborado por la Fundación Española de Enfermedades Neurológicas y avalado por la Sociedad Española de Neurología podemos obtener información más detallada sobre la enfermedad.




A la hora de buscar artículos de investigación en el área de neurociencias existen muchas revistas científicas. Unas de las que mayor factor de impacto tienen, corresponden a revisiones de los hechos más significativos en el campo de la neurociencia, incluyendo aspectos moleculares y celulares, neurogenética, desarrollo, plasticidad y reparación, comportamiento o neurociencia cognitiva.  Estas revistas son: Nature Reviews Neuroscience, con un factor de impacto de 30,44 y Annual Review of Neuroscience, con un factor de impacto de 25,74.





1. Formas de investigación en el campo de neurociencias.
2. Técnicas de imagen aplicadas a la investigación en neurología.
3. Analizar y comprender técnicas de biología molecular empleadas en neurociencias.
4. Enfermedad de Alzheimer: factores causales y dianas terapéuticas.

 

En el siguiente vídeo podéis ver 10 hechos curiosos relacionados con nuestro sistema nervioso.




La Sociedad Española de Neurología y la Biblioteca Nacional de España, han decidido poner en marcha la Semana de la Ciencia 2012, entre el 6 y el 17 de noviembre en Madrid. El Programa Científico cuenta con una programación con actividades culturales que abordarán la relación de la neurología con el arte, la literatura y la cultura en general. 

jueves, 11 de octubre de 2012

Redacción de artículos científicos - La Tesis Doctoral


Hemos destinado el principio de la clase a aclarar algunas dudas sobre qué constituye materia de examen. Para los que todavía andan algo despistados, el contenido de todas las clases teóricas, así como de las sesiones prácticas y talleres representa materia de evaluación tanto continuada como final. De igual modo, los pdfs facilitados por los profesores a través de ADI son materia de examen.



Por cierto, ya podéis consultar vuestras calificaciones en las últimas preguntas cortas realizadas en clase.


¡¡¡Ojo, pues habrá más... y queremos que estéis bien preparados!!!




El tema de hoy ha consistido en la presentación escrita de resultados científicos, de modo que hemos abordado principalmente la redacción de artículos de investigación biomédica, aunque también hemos mencionado el caso particular de la realización de la Tesis Doctoral.
 






Los artículos de investigación biomédica se encuentran sometidos a estrictas reglas de redacción y publicación, debiendo seguir en su mayoría las recomendaciones del Comité Internacional de Editores de Revistas Médicas (International Committee of Medical Journal Editors - ICMJE), que quedan recogidas en los requerimientos uniformes para los manuscritos enviados a las revistas biomédicas (Uniform Requirements for Manuscripts).

Los potenciales autores de publicaciones encontrarán en este documento valiosa ayuda respecto a cómo elaborar un manuscrito y mejorar su calidad y claridad de cara a facilitar su aceptación, aun en las revistas más exigentes. Cada revista tiene requerimientos propios, por lo que los autores deben estar familiarizados con las que se encuentren entre sus potenciales objetivos de publicación. 

En clase hemos visto ejemplos de los distintos tipos de artículos existentes y nos hemos detenido en comentar sus principales características. Si bien la mayor parte de artículos corresponden a trabajos de investigación originales, las revistas contienen también revisiones, editiorales, comentarios, perspectivas y cartas al director, entre otros.



Hemos hecho alusión a que la prestigiosa revista Nature dedica un comentario a la reciente concesión del Premio Nobel de Fisiología y Medicina a John Gurdon y Shinya Yamanaka. Los interesados en obtener más detalles podéis acceder a la página web oficial de los Premios Nobel.

Asimismo, os recomendamos entrar en el contenido que se encuentra en la pestaña titulada "Educational", ya que puede ser de utilidad para proporcionar ideas para vuestros trabajos en grupo


Consideraciones para la elaboración de un artículo de investigación

Una de las primeras cuestiones a considerar es la elección del foro adecuado al que queremos hacer llegar nuestros hallazgos científicos. Para ello tendremos en cuenta la relevancia y originalidad de nuestros resultados, nuestro ámbito de especialidad, así como los índices bibliométricos más recientes. La selección de la revista de nuestro interés debe ser objetiva y realista. El siguiente paso consiste en obtener las instrucciones de la revista de nuestra elección, ya que cada una tiene sus propios requisitos y peculiaridades.


Otro de los puntos clave en la elaboración de un primer borrador constituye decidir los autores del trabajo y el orden en el que van a figurar. Se considera como autor a alguien que ha contribuido sustancialmente en la realización del artículo ya sea en:
a) la concepción, diseño y adquisición de datos;
b) la revisión del contenido intelectual;
c) la aprobación de la versión en su forma final previa al envío.



La elección de un buen título resulta extraordinariamente importante. Debe ser informativo a la par que atractivo.




En un artículo científico los lectores deben encontrar la información suficiente para analizar las observaciones, repetir los experimentos y evaluar los procesos intelectuales que condujeron a su creación. El siguiente vídeo resume los principales apartados de un artículo y consejos de gran utilidad para su redacción.













La Tesis Doctoral



Para quienes consideran dedicarse a la investigación de forma profesional, la redacción de la tesis doctoral suele constituir, de ordinario, uno de los primeros retos de cierta envergadura, al menos en cuanto a extensión se refiere, que se tiene que afrontar. La obtención del grado de doctor es el requisito necesario para dedicarse a la docencia universitaria, así como para concurrir a determinadas promociones profesionales en el ejercicio de la Medicina. Dado que la normativa que rige los requisitos necesarios para la obtención de este título académico experimentará nuevos cambios para cuando os toque tomar tal decisión, hemos seleccionado algunos vídeos que os informen de manera seria, pero también divertida y amena, en qué consiste esta actividad a la vez apasionante, exigente, sacrificada y, en ocasiones, extenuante.








En ocasiones, la vida del doctorando es como una montaña rusa, donde se pasa de momentos "álgidos" a otros sumido en el "abismo", pero se trata de etapas "naturales" que hay que superar para alcanzar el objetivo final y que, a la postre, constituyen parte del "proceso formativo" de realizar la tesis. Dado que, en la actualidad, uno de los requisitos necesarios para defender la tesis doctoral consiste en haber publicado, los consejos que os hemos transmitido para la redacción de artículos de investigación biomédica resultan particularmente útiles.



 





¡¡¡Aunque es una experiencia exigente, tranquilos, al final se sobrevive!!! 




Con motivo de los Juegos Olímpicos celebrados este verano en Londres, el Design Museum -situado en la misma ciudad- alberga hasta el 18 de Noviembre de 2012 la exposición titulada "Designed to win", que explora las diversas maneras en las que el diseño ha modelado e influido en la actividad deportiva y viceversa, cómo el deporte puede promover el diseño, el arte y la cultura.


La exposición se compone de vídeos, fotografías, modelos y prototipos que ponen de manifiesto toda la investigación e innovación que subyace a muchos de los logros deportivos alcanzados hasta la actualidad. Como entre vosotros hay bastantes deportistas, pensamos que os puede resultar de interés. ¡Los aficionados al ciclismo podrán disfrutar muy particularmente! Aquí tenéis un vídeo con algunas breves explicaciones.







martes, 25 de septiembre de 2012

Búsqueda de información bibliográfica

La búsqueda de información científica es el conjunto de estrategias y operaciones necesarias para dar respuesta a las preguntas que nos formulamos tanto estudiantes, profesores, profesionales o investigadores. Cuando hablamos de información científica, nos referimos a información que ha sido evaluda por especialistas en la materia  y validada por la comunidad científica. 
La búsqueda bibliográfica es un elemento esencial para evaluar la importancia de la hipótesis de investigación y también para tomar decisiones sobre el cuidado o tratamiento de los pacientes. También nos ayuda a  elegir el tipo de diseño adecuado para nuestro estudio y aprender de los errores o limitaciones de los estudios previos.

Existen distintas fuentes de información científica según el tipo de  contenidos o forma en la que está estructurada: libros, revistas científicas, patentes, monografías, sitios web, tesis doctorales, etc.

Actualmente, la búsqueda de información científica resulta más sencilla gracias a los medios informáticos y electrónicos de los que disponemos. Existen diversas bases de datos que nos ayudan a la hora de buscar información científica: artículos de investigación, secuencias de genes, información sobre enfermedades, tesis doctorales o material fungible de investigación.
Además, todas las bases de datos os resultarán muy útiles para preparar los trabajos dirigidos ;-) !!!

- Cuál es el fin de la investigación: ¿qué clase de trabajo tengo que realizar? 
- Punto de partida: ¿qué conozco del tema?
    * recopilar lo que se sabe
    * ordenar los propios conocimientos
    * hacer un resumen de las principales ideas
    * centrar el tema en un área de conocimiento 
- Objetivo y alcance: ¿qué necesito para organizarme?
    * concretar el aspecto y naturaleza del tema a tratar
    * consultar la bibliografía
    * explorar la información existente sobre el tema
    * importancia de consultar a más de un autor 
- Elaborar un esquema del tema a tratar.




1. Los puntos fundamentales para realizar una búsqueda bibliográfica son: formular la pregunta adecuada según la investigación, confirmar que es la mejor evidencia posible consultando las fuentes pertinentes y garantizar la efectividad y precisión de los resultados de nuestra búsqueda.

2. En el proceso de búsqueda bibliográfica, efectividad es la habilidad para encontrar todos los items relevantes en la base de datos y precisión es la capacidad de encontrar los principales documentos relevantes. 

3. Seleccionar la base de datos adecuada según el tipo de información que se quiere obtener.

    - PubMed: artículos científicos. 
    - OMIM: información sobre el genotipo y fenotipo de enfermedades de herencia mendeliana. 
    - Gene: secuencias, símbolos, localización e información de genes. 
    - KEGG Pathways: vías de señalización e interacciones moleculares. 
   - Gene Ontology: descripción de los genes en términos de su asociación en procesos biológicos, componentes celulares y funciones moleculares. 
   - Google Scholar: artículos científicos y citas recibidas. 
   - Web of Knowledge: artículos científicos y citas recibidas. 
   - Biocompare: búsqueda de nuevos productos y tecnologías en el ámbito de la investigación. 
   - Clinical Trials: localización e información de ensayos clínicos. 

4. Conocer las características y funcionamiento de las bases de datos.






¿Qué tienen en común Ptolomeo I y Alejandro Amenábar?










Respuesta
Ptolomeo I fundó la famosa Biblioteca de Alejandría, que sería muy ampliada por su hijo Ptolomeo II. La quinta película de Amenábar es un drama histórico titulado Ágora, que se desarrolla en la ciudad de Alejandría, en la que un hecho fundamental del argumento es la destrucción de la legendaria Biblioteca de Alejandría. 



 PARA PRACTICAR...
 


1. Escribe en el formato de la revista Journal of Clinical Endocrinology and Metabolism la siguiente referencia bibliográfica: “Jortay J, Senou M, Abou-Samra M, Noel L, Robert A, Many MC, Brichard SM. Adiponectin and skeletal muscle: pathophysiological implications in metabolic stress. Am J Pathol. 2012 Jul;181(1):245-56.”

2. A través de Biocompare, ¿cuántos anticuerpos (fabricados en conejo) para detectar la proteína aquaporina 7 en un Western Blot en muestras de humanos y de la casa Abcam has encontrado?

3. ¿Se encuentra en la biblioteca de la Universidad de Navarra la revista American Journal of Pathology en formato online? ¿Desde qué año está disponible online en la biblioteca de la Universidad de Navarra la revista The American Journal of Clinical Nutrition?

4. Encuentra los nombres de 7 bases de datos en la siguiente sopa de letras.


5. Sobre el gen de la leptina cita:
    - Approved Gene Symbol:
    - Cytogenetic location:
    - OMIN Number:
    - Number of kD:
    - mRNA accesion number:





 

Respuestas

1. Jortay J, Senou M, Abou-Samra M, Noel L, Robert A, Many MC, Brichard SM 2012 Adiponectin and skeletal muscle: pathophysiological implications in metabolic stress. Am J Pathol 181:245-256

2. Tres


3. La revista American Journal of Pathology si está disponible  online en la biblioteca de la Universidad de Navarra. La revista The American Journal of Clinical Nutrition está disponible desde 1952.

4. OMIM, PUBMED, Web of knowledge, TESEO, Biocompare, GENE, KEGG






5. Sobre el gen de la leptina cita:
    - Approved Gene Symbol: LEP
    - Cytogenetic location: 7q31.3
    - OMIN Number: +164160
    - Number of kD: 16-kD
    - mRNA accesion number: NM_000230.2



El siguiente video nos recuerda los pasos que tenemos que seguir para utilizar las bases de datos de NCBI.